Jednoduchý dedinský farár bol za spišského biskupa vymenovaný 13. novembra 1920 v tajnom konzistóriu v Ríme. Jeho biskupská konsekrácia sa uskutočnila 13. februára 1921 v starobylej Nitre. Spolu s Jánom Vojtaššákom boli na biskupov vysvätení ešte dvaja: Karol Kmeťko a Marián Bláha. Konsekráciu vykonal nuncius Svätého stolca v Prahe Klement Micara. Túto udalosť si veriaci Spišského biskupstva pripomínajú každoročne vo svojich kostoloch. V rodisku Jána Vojtaššáka, Zákamennom, v pondelok 14. februára slávil svätú omšu pomocný biskup Štefan Sečka.